生物显微镜与金相显微镜在多个方面存在显著差异：
照明系统：生物显微镜采用透射照明，通常用于观察透明和半透明样品，但不能用于观察不透明物体。而金相显微镜主要采用落射照明方式（也叫同轴照明），光源从物镜射出，主要用于观察不透明样本的表面。一些金相显微镜也配备透射照明装置，以便同时观察透明样本。
放大倍数：生物显微镜的放大倍数通常可达2000倍左右，而金相显微镜的放大倍数相对较小，一般可达200倍左右。
景深范围：金相显微镜的景深范围大，可达10mm，这有助于观察三维图像。生物显微镜的景深范围则较小。
工作距离：金相显微镜的工作距离较大，通常可达50mm甚至150mm，而生物显微镜检测物体的工作距离范围很少超过20mm。
适用范围：生物显微镜主要用于观察生物切片或活体组织等，而金相显微镜主要用于观察金属或其它材料的金相组织。
总的来说，生物显微镜和金相显微镜在照明系统、放大倍数、景深范围、工作距离和适用范围等方面均存在不同，需根据具体需求进行选择。
